PDB-REPRDB table

PDB-REPRDB V1923.0 (PDB Rel. #2000_08_06 に基づく)
(最終更新日: 1970年1月1日)

PDB(Protein Data Bank) 代表タンパク質チェインデータベース

(ドキュメントを御覧下さい)

Since 01/Apr/98

PDB-REPRDB 選出基準

各々の代表タンパク質チェインは、下記の２つの基準で互いに類似性のないチェインと判断されました。
a ) 配列上の類似性 (ID% =< 閾値１)

ID% : 残基一致率
２つの配列を比較した時、対応する残基間で一致する残基の比率
b ) 立体構造上の類似性 ( Dmax >= 閾値２ )

Dmax : 対応原子間距離の最大値
２つの立体構造を重ね合わせた時、対応する残基のＣα原子間距離の最大値

この表、および代表チェインは 1970年1月1日に更新されました。