PDB-REPRDB (PDB Rel. #2010_05_14 に基づく)
(最終更新日: 2011年1月5日)

Since 01/Apr/98

タンパク質チェインの選択・整列条件は こちら を御覧下さい。

各々の代表タンパク質チェインは、下記の２つの基準で互いに類似性のないチェインと判断されました。

a ) 配列上の類似性 (ID% =< 閾値１)

ID% : 残基一致率

２つの配列を比較した時、対応する残基間で一致する残基の比率

b ) 立体構造上の類似性 ( Dmax >= 閾値２ )

Dmax : 対応原子間距離の最大値

２つの立体構造を重ね合わせた時、対応する残基のＣα原子間距離の最大値

ID%	チェイン数
	Dmax (A)
	>= 10	>= 30	>= 50	無限
=< 30	19959	11780	11035	10919
=< 50	22664	18466	18074	17994
=< 70	25283	21769	21420	21342
=< 90	29685	26719	26425	26366

この表、および代表チェインは 2011年1月5日 に更新されました。

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ヘルプ

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PDB代表タンパク質チェイン決定システム